Perjalanan dari Wakatobi ke Ambon biasanya memerlukan dokumen khusus. Untuk penerbangan antarabangsa, pasport selalu diperlukan. Walaubagaimanapun, untuk penerbangan domestik, biasanya tiada pasport atau visa diperlukan, selain ID rasmi. Keperluan visa bergantung kepada kewarganegaraan pelancong dan peraturan kemasukan Ambon. Adalah penting untuk mengesahkan keperluan visa, kerana peraturan boleh berbeza-beza antara negara.